与 R/R 库的比较#
由于 pandas 旨在提供人们使用 R 进行的大量数据操作和分析功能，因此创建了此页面，以更详细地了解 R 语言 及其许多与 pandas 相关的第三方库。在与 R 和 CRAN 库的比较中，我们关注以下事项
功能/灵活性：每个工具可以/不能做什么
性能：操作的速度。优先考虑硬性数字/基准测试
易用性: 哪个工具更容易/更难使用（您可能需要根据并排代码比较来判断）
此页面还提供了一些针对这些 R 包用户的翻译指南。
快速参考#
我们将从一个快速参考指南开始，将一些使用 dplyr 的常见 R 操作与 pandas 等效项配对。
查询、过滤、采样#
R |
pandas |
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排序#
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转换#
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分组和汇总#
R |
pandas |
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基础 R#
使用 R 的 c 切片#
R 使得通过名称访问 data.frame 列变得容易
df <- data.frame(a=rnorm(5), b=rnorm(5), c=rnorm(5), d=rnorm(5), e=rnorm(5))
df[, c("a", "c", "e")]
或通过整数位置
df <- data.frame(matrix(rnorm(1000), ncol=100))
df[, c(1:10, 25:30, 40, 50:100)]
在 pandas 中通过名称选择多个列很简单
In [1]: df = pd.DataFrame(np.random.randn(10, 3), columns=list("abc"))
In [2]: df[["a", "c"]]
Out[2]:
a c
0 0.469112 -1.509059
1 -1.135632 -0.173215
2 0.119209 -0.861849
3 -2.104569 1.071804
4 0.721555 -1.039575
5 0.271860 0.567020
6 0.276232 -0.673690
7 0.113648 0.524988
8 0.404705 -1.715002
9 -1.039268 -1.157892
In [3]: df.loc[:, ["a", "c"]]
Out[3]:
a c
0 0.469112 -1.509059
1 -1.135632 -0.173215
2 0.119209 -0.861849
3 -2.104569 1.071804
4 0.721555 -1.039575
5 0.271860 0.567020
6 0.276232 -0.673690
7 0.113648 0.524988
8 0.404705 -1.715002
9 -1.039268 -1.157892
通过整数位置选择多个非连续列可以通过组合 iloc 索引器属性和 numpy.r_ 来实现。
In [4]: named = list("abcdefg")
In [5]: n = 30
In [6]: columns = named + np.arange(len(named), n).tolist()
In [7]: df = pd.DataFrame(np.random.randn(n, n), columns=columns)
In [8]: df.iloc[:, np.r_[:10, 24:30]]
Out[8]:
a b c ... 27 28 29
0 -1.344312 0.844885 1.075770 ... 0.813850 0.132003 -0.827317
1 -0.076467 -1.187678 1.130127 ... 0.149748 -0.732339 0.687738
2 0.176444 0.403310 -0.154951 ... -0.493662 0.600178 0.274230
3 0.132885 -0.023688 2.410179 ... 0.109121 1.126203 -0.977349
4 1.474071 -0.064034 -1.282782 ... -0.858447 0.306996 -0.028665
.. ... ... ... ... ... ... ...
25 1.492125 -0.068190 0.681456 ... 0.428572 0.880609 0.487645
26 0.725238 0.624607 -0.141185 ... 1.008500 1.424017 0.717110
27 1.262419 1.950057 0.301038 ... 1.007824 2.826008 1.458383
28 -1.585746 -0.899734 0.921494 ... 0.577223 -1.088417 0.326687
29 -0.986248 0.169729 -1.158091 ... -2.013086 -1.602549 0.333109
[30 rows x 16 columns]
aggregate#
在 R 中，您可能希望将数据分成子集并计算每个子集的平均值。使用名为 df 的 data.frame 并将其分成 by1 和 by2 组
df <- data.frame(
v1 = c(1,3,5,7,8,3,5,NA,4,5,7,9),
v2 = c(11,33,55,77,88,33,55,NA,44,55,77,99),
by1 = c("red", "blue", 1, 2, NA, "big", 1, 2, "red", 1, NA, 12),
by2 = c("wet", "dry", 99, 95, NA, "damp", 95, 99, "red", 99, NA, NA))
aggregate(x=df[, c("v1", "v2")], by=list(mydf2$by1, mydf2$by2), FUN = mean)
groupby() 方法类似于基础 R aggregate 函数。
In [9]: df = pd.DataFrame(
...: {
...: "v1": [1, 3, 5, 7, 8, 3, 5, np.nan, 4, 5, 7, 9],
...: "v2": [11, 33, 55, 77, 88, 33, 55, np.nan, 44, 55, 77, 99],
...: "by1": ["red", "blue", 1, 2, np.nan, "big", 1, 2, "red", 1, np.nan, 12],
...: "by2": [
...: "wet",
...: "dry",
...: 99,
...: 95,
...: np.nan,
...: "damp",
...: 95,
...: 99,
...: "red",
...: 99,
...: np.nan,
...: np.nan,
...: ],
...: }
...: )
...:
In [10]: g = df.groupby(["by1", "by2"])
In [11]: g[["v1", "v2"]].mean()
Out[11]:
v1 v2
by1 by2
1 95 5.0 55.0
99 5.0 55.0
2 95 7.0 77.0
99 NaN NaN
big damp 3.0 33.0
blue dry 3.0 33.0
red red 4.0 44.0
wet 1.0 11.0
有关更多详细信息和示例，请参见 groupby 文档。
match / %in%#
在 R 中选择数据的一种常见方法是使用 %in%，它使用函数 match 定义。运算符 %in% 用于返回一个逻辑向量，指示是否存在匹配项
s <- 0:4
s %in% c(2,4)
The isin() method is similar to R %in% operator
In [12]: s = pd.Series(np.arange(5), dtype=np.float32)
In [13]: s.isin([2, 4])
Out[13]:
0 False
1 False
2 True
3 False
4 True
dtype: bool
The match function returns a vector of the positions of matches of its first argument in its second
s <- 0:4
match(s, c(2,4))
For more details and examples see the reshaping documentation.
tapply#
tapply 与 aggregate 类似，但数据可以存储在不规则数组中，因为子类的大小可能不规则。使用名为 baseball 的 data.frame，并根据数组 team 检索信息
baseball <-
data.frame(team = gl(5, 5,
labels = paste("Team", LETTERS[1:5])),
player = sample(letters, 25),
batting.average = runif(25, .200, .400))
tapply(baseball$batting.average, baseball.example$team,
max)
在 pandas 中，我们可以使用 pivot_table() 方法来处理这种情况
In [14]: import random
In [15]: import string
In [16]: baseball = pd.DataFrame(
....: {
....: "team": ["team %d" % (x + 1) for x in range(5)] * 5,
....: "player": random.sample(list(string.ascii_lowercase), 25),
....: "batting avg": np.random.uniform(0.200, 0.400, 25),
....: }
....: )
....:
In [17]: baseball.pivot_table(values="batting avg", columns="team", aggfunc="max")
Out[17]:
team team 1 team 2 team 3 team 4 team 5
batting avg 0.352134 0.295327 0.397191 0.394457 0.396194
For more details and examples see the reshaping documentation.
subset#
The query() method is similar to the base R subset function. In R you might want to get the rows of a data.frame where one column’s values are less than another column’s values
df <- data.frame(a=rnorm(10), b=rnorm(10))
subset(df, a <= b)
df[df$a <= df$b,] # note the comma
在 pandas 中，有几种方法可以进行子集选择。您可以使用 query() 或传递表达式，就像它是索引/切片一样，以及标准布尔索引
In [18]: df = pd.DataFrame({"a": np.random.randn(10), "b": np.random.randn(10)})
In [19]: df.query("a <= b")
Out[19]:
a b
1 0.174950 0.552887
2 -0.023167 0.148084
3 -0.495291 -0.300218
4 -0.860736 0.197378
5 -1.134146 1.720780
7 -0.290098 0.083515
8 0.238636 0.946550
In [20]: df[df["a"] <= df["b"]]
Out[20]:
a b
1 0.174950 0.552887
2 -0.023167 0.148084
3 -0.495291 -0.300218
4 -0.860736 0.197378
5 -1.134146 1.720780
7 -0.290098 0.083515
8 0.238636 0.946550
In [21]: df.loc[df["a"] <= df["b"]]
Out[21]:
a b
1 0.174950 0.552887
2 -0.023167 0.148084
3 -0.495291 -0.300218
4 -0.860736 0.197378
5 -1.134146 1.720780
7 -0.290098 0.083515
8 0.238636 0.946550
For more details and examples see the query documentation.
with#
在 R 中，使用名为 df 的数据框，其中包含列 a 和 b 的表达式，可以使用 with 进行评估，如下所示
df <- data.frame(a=rnorm(10), b=rnorm(10))
with(df, a + b)
df$a + df$b # same as the previous expression
在 pandas 中，使用 eval() 方法，等效的表达式为
In [22]: df = pd.DataFrame({"a": np.random.randn(10), "b": np.random.randn(10)})
In [23]: df.eval("a + b")
Out[23]:
0 -0.091430
1 -2.483890
2 -0.252728
3 -0.626444
4 -0.261740
5 2.149503
6 -0.332214
7 0.799331
8 -2.377245
9 2.104677
dtype: float64
In [24]: df["a"] + df["b"] # same as the previous expression
Out[24]:
0 -0.091430
1 -2.483890
2 -0.252728
3 -0.626444
4 -0.261740
5 2.149503
6 -0.332214
7 0.799331
8 -2.377245
9 2.104677
dtype: float64
在某些情况下，eval() 的速度将比纯 Python 中的评估快得多。有关更多详细信息和示例，请参见 eval 文档。
plyr#
plyr 是一个 R 库，用于数据分析的拆分-应用-合并策略。这些函数围绕 R 中的三个数据结构展开，a 代表 数组，l 代表 列表，d 代表 数据框。下表显示了这些数据结构如何在 Python 中映射。
R |
Python |
|---|---|
数组 |
列表 |
列表 |
字典或对象列表 |
数据框 |
数据框 |
ddply#
在 R 中，使用名为 df 的数据框，其中您希望按 month 对 x 进行汇总的表达式
require(plyr)
df <- data.frame(
x = runif(120, 1, 168),
y = runif(120, 7, 334),
z = runif(120, 1.7, 20.7),
month = rep(c(5,6,7,8),30),
week = sample(1:4, 120, TRUE)
)
ddply(df, .(month, week), summarize,
mean = round(mean(x), 2),
sd = round(sd(x), 2))
在 pandas 中，使用 groupby() 方法，等效的表达式为
In [25]: df = pd.DataFrame(
....: {
....: "x": np.random.uniform(1.0, 168.0, 120),
....: "y": np.random.uniform(7.0, 334.0, 120),
....: "z": np.random.uniform(1.7, 20.7, 120),
....: "month": [5, 6, 7, 8] * 30,
....: "week": np.random.randint(1, 4, 120),
....: }
....: )
....:
In [26]: grouped = df.groupby(["month", "week"])
In [27]: grouped["x"].agg(["mean", "std"])
Out[27]:
mean std
month week
5 1 63.653367 40.601965
2 78.126605 53.342400
3 92.091886 57.630110
6 1 81.747070 54.339218
2 70.971205 54.687287
3 100.968344 54.010081
7 1 61.576332 38.844274
2 61.733510 48.209013
3 71.688795 37.595638
8 1 62.741922 34.618153
2 91.774627 49.790202
3 73.936856 60.773900
有关更多详细信息和示例，请参见 groupby 文档。
reshape / reshape2#
meltarray#
在 R 中，使用名为 a 的三维数组，其中您希望将其熔化成数据框的表达式
a <- array(c(1:23, NA), c(2,3,4))
data.frame(melt(a))
在 Python 中，由于 a 是一个列表，您可以简单地使用列表推导。
In [28]: a = np.array(list(range(1, 24)) + [np.NAN]).reshape(2, 3, 4)
In [29]: pd.DataFrame([tuple(list(x) + [val]) for x, val in np.ndenumerate(a)])
Out[29]:
0 1 2 3
0 0 0 0 1.0
1 0 0 1 2.0
2 0 0 2 3.0
3 0 0 3 4.0
4 0 1 0 5.0
.. .. .. .. ...
19 1 1 3 20.0
20 1 2 0 21.0
21 1 2 1 22.0
22 1 2 2 23.0
23 1 2 3 NaN
[24 rows x 4 columns]
meltlist#
在 R 中，使用一个名为 a 的列表的表达式，您希望将其熔化成一个 data.frame。
a <- as.list(c(1:4, NA))
data.frame(melt(a))
在 Python 中，此列表将是一个元组列表，因此 DataFrame() 方法将根据需要将其转换为数据帧。
In [30]: a = list(enumerate(list(range(1, 5)) + [np.NAN]))
In [31]: pd.DataFrame(a)
Out[31]:
0 1
0 0 1.0
1 1 2.0
2 2 3.0
3 3 4.0
4 4 NaN
有关更多详细信息和示例，请参阅 数据结构介绍文档。
meltdf#
在 R 中，使用一个名为 cheese 的 data.frame 的表达式，您希望重塑 data.frame。
cheese <- data.frame(
first = c('John', 'Mary'),
last = c('Doe', 'Bo'),
height = c(5.5, 6.0),
weight = c(130, 150)
)
melt(cheese, id=c("first", "last"))
在 Python 中，melt() 方法等效于 R。
In [32]: cheese = pd.DataFrame(
....: {
....: "first": ["John", "Mary"],
....: "last": ["Doe", "Bo"],
....: "height": [5.5, 6.0],
....: "weight": [130, 150],
....: }
....: )
....:
In [33]: pd.melt(cheese, id_vars=["first", "last"])
Out[33]:
first last variable value
0 John Doe height 5.5
1 Mary Bo height 6.0
2 John Doe weight 130.0
3 Mary Bo weight 150.0
In [34]: cheese.set_index(["first", "last"]).stack(future_stack=True) # alternative way
Out[34]:
first last
John Doe height 5.5
weight 130.0
Mary Bo height 6.0
weight 150.0
dtype: float64
有关更多详细信息和示例，请参阅 重塑文档。
cast#
在 R 中，acast 是使用一个名为 df 的 data.frame 的表达式，用于将其转换为更高维度的数组。
df <- data.frame(
x = runif(12, 1, 168),
y = runif(12, 7, 334),
z = runif(12, 1.7, 20.7),
month = rep(c(5,6,7),4),
week = rep(c(1,2), 6)
)
mdf <- melt(df, id=c("month", "week"))
acast(mdf, week ~ month ~ variable, mean)
在 Python 中，最好的方法是使用 pivot_table()。
In [35]: df = pd.DataFrame(
....: {
....: "x": np.random.uniform(1.0, 168.0, 12),
....: "y": np.random.uniform(7.0, 334.0, 12),
....: "z": np.random.uniform(1.7, 20.7, 12),
....: "month": [5, 6, 7] * 4,
....: "week": [1, 2] * 6,
....: }
....: )
....:
In [36]: mdf = pd.melt(df, id_vars=["month", "week"])
In [37]: pd.pivot_table(
....: mdf,
....: values="value",
....: index=["variable", "week"],
....: columns=["month"],
....: aggfunc="mean",
....: )
....:
Out[37]:
month 5 6 7
variable week
x 1 93.888747 98.762034 55.219673
2 94.391427 38.112932 83.942781
y 1 94.306912 279.454811 227.840449
2 87.392662 193.028166 173.899260
z 1 11.016009 10.079307 16.170549
2 8.476111 17.638509 19.003494
同样，对于 dcast，它使用一个名为 df 的 data.frame 在 R 中根据 Animal 和 FeedType 聚合信息。
df <- data.frame(
Animal = c('Animal1', 'Animal2', 'Animal3', 'Animal2', 'Animal1',
'Animal2', 'Animal3'),
FeedType = c('A', 'B', 'A', 'A', 'B', 'B', 'A'),
Amount = c(10, 7, 4, 2, 5, 6, 2)
)
dcast(df, Animal ~ FeedType, sum, fill=NaN)
# Alternative method using base R
with(df, tapply(Amount, list(Animal, FeedType), sum))
Python 可以通过两种不同的方式来实现这一点。首先，类似于上面使用 pivot_table()
In [38]: df = pd.DataFrame(
....: {
....: "Animal": [
....: "Animal1",
....: "Animal2",
....: "Animal3",
....: "Animal2",
....: "Animal1",
....: "Animal2",
....: "Animal3",
....: ],
....: "FeedType": ["A", "B", "A", "A", "B", "B", "A"],
....: "Amount": [10, 7, 4, 2, 5, 6, 2],
....: }
....: )
....:
In [39]: df.pivot_table(values="Amount", index="Animal", columns="FeedType", aggfunc="sum")
Out[39]:
FeedType A B
Animal
Animal1 10.0 5.0
Animal2 2.0 13.0
Animal3 6.0 NaN
第二种方法是使用 groupby() 方法
In [40]: df.groupby(["Animal", "FeedType"])["Amount"].sum()
Out[40]:
Animal FeedType
Animal1 A 10
B 5
Animal2 A 2
B 13
Animal3 A 6
Name: Amount, dtype: int64
factor#
pandas 具有用于分类数据的类型。
cut(c(1,2,3,4,5,6), 3)
factor(c(1,2,3,2,2,3))
在 pandas 中，这是通过 pd.cut 和 astype("category") 来实现的
In [41]: pd.cut(pd.Series([1, 2, 3, 4, 5, 6]), 3)
Out[41]:
0 (0.995, 2.667]
1 (0.995, 2.667]
2 (2.667, 4.333]
3 (2.667, 4.333]
4 (4.333, 6.0]
5 (4.333, 6.0]
dtype: category
Categories (3, interval[float64, right]): [(0.995, 2.667] < (2.667, 4.333] < (4.333, 6.0]]
In [42]: pd.Series([1, 2, 3, 2, 2, 3]).astype("category")
Out[42]:
0 1
1 2
2 3
3 2
4 2
5 3
dtype: category
Categories (3, int64): [1, 2, 3]
有关更多详细信息和示例，请参阅 分类介绍 和 API 文档。还有一些关于 与 R 的 factor 的区别 的文档。