与 Stata 的比较#

对于来自 Stata 的潜在用户,此页面旨在演示如何在 pandas 中执行不同的 Stata 操作。

如果您是 pandas 的新手,您可能需要先阅读 10 分钟了解 pandas 以熟悉该库。

按照惯例,我们导入 pandas 和 NumPy 如下

In [1]: import pandas as pd

In [2]: import numpy as np

数据结构#

通用术语翻译#

pandas

Stata

DataFrame

数据集

变量

观测值

分组

按排序分组

NaN

.

DataFrame#

pandas 中的 DataFrame 类似于 Stata 数据集 - 一个具有标记列的二维数据源,这些列可以是不同类型。正如本文档中将要展示的,几乎任何可以应用于 Stata 中数据集的操作也可以在 pandas 中完成。

Series#

Series 是表示 DataFrame 中一列的数据结构。Stata 没有单独的数据结构来表示单列,但通常,使用 Series 类似于在 Stata 中引用数据集的一列。

Index#

每个 DataFrameSeries 都有一个 Index - 数据的标签。Stata 没有完全类似的概念。在 Stata 中,数据集的行本质上是无标签的,除了一个隐式整数索引,可以使用 _n 访问。

在 pandas 中,如果没有指定索引,默认情况下也会使用整数索引(第一行 = 0,第二行 = 1,依此类推)。虽然使用带标签的 IndexMultiIndex 可以实现复杂的分析,并且最终是 pandas 中需要理解的重要部分,但为了进行比较,我们将基本上忽略 Index,并将 DataFrame 视为列的集合。有关如何有效使用 Index 的更多信息,请参阅 索引文档

副本与就地操作#

大多数 pandas 操作会返回 Series/DataFrame 的副本。要使更改“生效”,您需要将其分配给一个新变量

sorted_df = df.sort_values("col1")

或覆盖原始变量

df = df.sort_values("col1")

注意

您会看到一些方法中提供了 inplace=Truecopy=False 关键字参数

df.replace(5, inplace=True)

目前正在积极讨论是否弃用和删除大多数方法(例如 dropna)中的 inplacecopy,但一小部分方法(包括 replace)除外。在 Copy-on-Write 的背景下,这两个关键字将不再需要。您可以 在这里找到该提案。

数据输入/输出#

从值构建 DataFrame#

可以通过在 input 语句后放置数据并指定列名来构建 Stata 数据集。

input x y
1 2
3 4
5 6
end

pandas DataFrame 可以通过多种方式构建,但对于少量值,通常将它指定为 Python 字典会很方便,其中键是列名,值是数据。

In [3]: df = pd.DataFrame({"x": [1, 3, 5], "y": [2, 4, 6]})

In [4]: df
Out[4]: 
   x  y
0  1  2
1  3  4
2  5  6

读取外部数据#

与 Stata 类似,pandas 提供了从多种格式读取数据的实用程序。在以下许多示例中,将使用 pandas 测试中找到的 tips 数据集(csv)。

Stata 提供 import delimited 将 csv 数据读取到内存中的数据集。如果 tips.csv 文件位于当前工作目录中,我们可以按如下方式导入它。

import delimited tips.csv

pandas 方法是 read_csv(),其工作方式类似。此外,如果提供 URL,它会自动下载数据集。

In [5]: url = (
   ...:     "https://raw.githubusercontent.com/pandas-dev"
   ...:     "/pandas/main/pandas/tests/io/data/csv/tips.csv"
   ...: )
   ...: 

In [6]: tips = pd.read_csv(url)

In [7]: tips
Out[7]: 
     total_bill   tip     sex smoker   day    time  size
0         16.99  1.01  Female     No   Sun  Dinner     2
1         10.34  1.66    Male     No   Sun  Dinner     3
2         21.01  3.50    Male     No   Sun  Dinner     3
3         23.68  3.31    Male     No   Sun  Dinner     2
4         24.59  3.61  Female     No   Sun  Dinner     4
..          ...   ...     ...    ...   ...     ...   ...
239       29.03  5.92    Male     No   Sat  Dinner     3
240       27.18  2.00  Female    Yes   Sat  Dinner     2
241       22.67  2.00    Male    Yes   Sat  Dinner     2
242       17.82  1.75    Male     No   Sat  Dinner     2
243       18.78  3.00  Female     No  Thur  Dinner     2

[244 rows x 7 columns]

import delimited 类似,read_csv() 可以接受许多参数来指定如何解析数据。例如,如果数据是制表符分隔的,没有列名,并且存在于当前工作目录中,则 pandas 命令将是

tips = pd.read_csv("tips.csv", sep="\t", header=None)

# alternatively, read_table is an alias to read_csv with tab delimiter
tips = pd.read_table("tips.csv", header=None)

pandas 也可以使用 read_stata() 函数读取 Stata 数据集,该数据集以 .dta 格式存储。

df = pd.read_stata("data.dta")

除了文本/csv 和 Stata 文件外,pandas 还支持多种其他数据格式,例如 Excel、SAS、HDF5、Parquet 和 SQL 数据库。这些格式都通过 pd.read_* 函数读取。有关更多详细信息,请参阅 IO 文档

限制输出#

默认情况下,pandas 会截断大型 DataFrame 的输出,以显示第一行和最后一行。可以通过 更改 pandas 选项 或使用 DataFrame.head()DataFrame.tail() 来覆盖此行为。

In [8]: tips.head(5)
Out[8]: 
   total_bill   tip     sex smoker  day    time  size
0       16.99  1.01  Female     No  Sun  Dinner     2
1       10.34  1.66    Male     No  Sun  Dinner     3
2       21.01  3.50    Male     No  Sun  Dinner     3
3       23.68  3.31    Male     No  Sun  Dinner     2
4       24.59  3.61  Female     No  Sun  Dinner     4

在 Stata 中,等效的操作是

list in 1/5

导出数据#

Stata 中 import delimited 的反向操作是 export delimited

export delimited tips2.csv

类似地,在 pandas 中,read_csv 的反向操作是 DataFrame.to_csv()

tips.to_csv("tips2.csv")

pandas 也可以使用 DataFrame.to_stata() 方法导出到 Stata 文件格式。

tips.to_stata("tips2.dta")

数据操作#

对列的操作#

在 Stata 中,可以使用任意数学表达式与 generatereplace 命令对新列或现有列进行操作。 drop 命令会从数据集中删除该列。

replace total_bill = total_bill - 2
generate new_bill = total_bill / 2
drop new_bill

pandas 通过指定 DataFrame 中的各个 Series 来提供向量化操作。新列可以以相同的方式分配。 DataFrame.drop() 方法从 DataFrame 中删除一列。

In [9]: tips["total_bill"] = tips["total_bill"] - 2

In [10]: tips["new_bill"] = tips["total_bill"] / 2

In [11]: tips
Out[11]: 
     total_bill   tip     sex smoker   day    time  size  new_bill
0         14.99  1.01  Female     No   Sun  Dinner     2     7.495
1          8.34  1.66    Male     No   Sun  Dinner     3     4.170
2         19.01  3.50    Male     No   Sun  Dinner     3     9.505
3         21.68  3.31    Male     No   Sun  Dinner     2    10.840
4         22.59  3.61  Female     No   Sun  Dinner     4    11.295
..          ...   ...     ...    ...   ...     ...   ...       ...
239       27.03  5.92    Male     No   Sat  Dinner     3    13.515
240       25.18  2.00  Female    Yes   Sat  Dinner     2    12.590
241       20.67  2.00    Male    Yes   Sat  Dinner     2    10.335
242       15.82  1.75    Male     No   Sat  Dinner     2     7.910
243       16.78  3.00  Female     No  Thur  Dinner     2     8.390

[244 rows x 8 columns]

In [12]: tips = tips.drop("new_bill", axis=1)

过滤#

Stata 中的过滤是通过对一列或多列使用 if 子句完成的。

list if total_bill > 10

DataFrame 可以通过多种方式进行过滤;其中最直观的方式是使用 布尔索引

In [13]: tips[tips["total_bill"] > 10]
Out[13]: 
     total_bill   tip     sex smoker   day    time  size
0         14.99  1.01  Female     No   Sun  Dinner     2
2         19.01  3.50    Male     No   Sun  Dinner     3
3         21.68  3.31    Male     No   Sun  Dinner     2
4         22.59  3.61  Female     No   Sun  Dinner     4
5         23.29  4.71    Male     No   Sun  Dinner     4
..          ...   ...     ...    ...   ...     ...   ...
239       27.03  5.92    Male     No   Sat  Dinner     3
240       25.18  2.00  Female    Yes   Sat  Dinner     2
241       20.67  2.00    Male    Yes   Sat  Dinner     2
242       15.82  1.75    Male     No   Sat  Dinner     2
243       16.78  3.00  Female     No  Thur  Dinner     2

[204 rows x 7 columns]

上面的语句只是将一个 True/False 对象的 Series 传递给 DataFrame,返回所有 True 的行。

In [14]: is_dinner = tips["time"] == "Dinner"

In [15]: is_dinner
Out[15]: 
0      True
1      True
2      True
3      True
4      True
       ... 
239    True
240    True
241    True
242    True
243    True
Name: time, Length: 244, dtype: bool

In [16]: is_dinner.value_counts()
Out[16]: 
time
True     176
False     68
Name: count, dtype: int64

In [17]: tips[is_dinner]
Out[17]: 
     total_bill   tip     sex smoker   day    time  size
0         14.99  1.01  Female     No   Sun  Dinner     2
1          8.34  1.66    Male     No   Sun  Dinner     3
2         19.01  3.50    Male     No   Sun  Dinner     3
3         21.68  3.31    Male     No   Sun  Dinner     2
4         22.59  3.61  Female     No   Sun  Dinner     4
..          ...   ...     ...    ...   ...     ...   ...
239       27.03  5.92    Male     No   Sat  Dinner     3
240       25.18  2.00  Female    Yes   Sat  Dinner     2
241       20.67  2.00    Male    Yes   Sat  Dinner     2
242       15.82  1.75    Male     No   Sat  Dinner     2
243       16.78  3.00  Female     No  Thur  Dinner     2

[176 rows x 7 columns]

If/then 逻辑#

在 Stata 中,if 子句也可以用来创建新列。

generate bucket = "low" if total_bill < 10
replace bucket = "high" if total_bill >= 10

pandas 中的相同操作可以使用 numpy 中的 where 方法完成。

In [18]: tips["bucket"] = np.where(tips["total_bill"] < 10, "low", "high")

In [19]: tips
Out[19]: 
     total_bill   tip     sex smoker   day    time  size bucket
0         14.99  1.01  Female     No   Sun  Dinner     2   high
1          8.34  1.66    Male     No   Sun  Dinner     3    low
2         19.01  3.50    Male     No   Sun  Dinner     3   high
3         21.68  3.31    Male     No   Sun  Dinner     2   high
4         22.59  3.61  Female     No   Sun  Dinner     4   high
..          ...   ...     ...    ...   ...     ...   ...    ...
239       27.03  5.92    Male     No   Sat  Dinner     3   high
240       25.18  2.00  Female    Yes   Sat  Dinner     2   high
241       20.67  2.00    Male    Yes   Sat  Dinner     2   high
242       15.82  1.75    Male     No   Sat  Dinner     2   high
243       16.78  3.00  Female     No  Thur  Dinner     2   high

[244 rows x 8 columns]

日期功能#

Stata 提供了各种函数来对日期/日期时间列进行操作。

generate date1 = mdy(1, 15, 2013)
generate date2 = date("Feb152015", "MDY")

generate date1_year = year(date1)
generate date2_month = month(date2)

* shift date to beginning of next month
generate date1_next = mdy(month(date1) + 1, 1, year(date1)) if month(date1) != 12
replace date1_next = mdy(1, 1, year(date1) + 1) if month(date1) == 12
generate months_between = mofd(date2) - mofd(date1)

list date1 date2 date1_year date2_month date1_next months_between

等效的 pandas 操作如下所示。除了这些函数之外,pandas 还支持 Stata 中没有的其他时间序列功能(例如时区处理和自定义偏移量) - 有关更多详细信息,请参阅 时间序列文档

In [20]: tips["date1"] = pd.Timestamp("2013-01-15")

In [21]: tips["date2"] = pd.Timestamp("2015-02-15")

In [22]: tips["date1_year"] = tips["date1"].dt.year

In [23]: tips["date2_month"] = tips["date2"].dt.month

In [24]: tips["date1_next"] = tips["date1"] + pd.offsets.MonthBegin()

In [25]: tips["months_between"] = tips["date2"].dt.to_period("M") - tips[
   ....:     "date1"
   ....: ].dt.to_period("M")
   ....: 

In [26]: tips[
   ....:     ["date1", "date2", "date1_year", "date2_month", "date1_next", "months_between"]
   ....: ]
   ....: 
Out[26]: 
         date1      date2  date1_year  date2_month date1_next    months_between
0   2013-01-15 2015-02-15        2013            2 2013-02-01  <25 * MonthEnds>
1   2013-01-15 2015-02-15        2013            2 2013-02-01  <25 * MonthEnds>
2   2013-01-15 2015-02-15        2013            2 2013-02-01  <25 * MonthEnds>
3   2013-01-15 2015-02-15        2013            2 2013-02-01  <25 * MonthEnds>
4   2013-01-15 2015-02-15        2013            2 2013-02-01  <25 * MonthEnds>
..         ...        ...         ...          ...        ...               ...
239 2013-01-15 2015-02-15        2013            2 2013-02-01  <25 * MonthEnds>
240 2013-01-15 2015-02-15        2013            2 2013-02-01  <25 * MonthEnds>
241 2013-01-15 2015-02-15        2013            2 2013-02-01  <25 * MonthEnds>
242 2013-01-15 2015-02-15        2013            2 2013-02-01  <25 * MonthEnds>
243 2013-01-15 2015-02-15        2013            2 2013-02-01  <25 * MonthEnds>

[244 rows x 6 columns]

列的选择#

Stata 提供了关键字来选择、删除和重命名列。

keep sex total_bill tip

drop sex

rename total_bill total_bill_2

相同的操作在下面的 pandas 中表达。

保留某些列#

In [27]: tips[["sex", "total_bill", "tip"]]
Out[27]: 
        sex  total_bill   tip
0    Female       14.99  1.01
1      Male        8.34  1.66
2      Male       19.01  3.50
3      Male       21.68  3.31
4    Female       22.59  3.61
..      ...         ...   ...
239    Male       27.03  5.92
240  Female       25.18  2.00
241    Male       20.67  2.00
242    Male       15.82  1.75
243  Female       16.78  3.00

[244 rows x 3 columns]

删除一列#

In [28]: tips.drop("sex", axis=1)
Out[28]: 
     total_bill   tip smoker   day    time  size
0         14.99  1.01     No   Sun  Dinner     2
1          8.34  1.66     No   Sun  Dinner     3
2         19.01  3.50     No   Sun  Dinner     3
3         21.68  3.31     No   Sun  Dinner     2
4         22.59  3.61     No   Sun  Dinner     4
..          ...   ...    ...   ...     ...   ...
239       27.03  5.92     No   Sat  Dinner     3
240       25.18  2.00    Yes   Sat  Dinner     2
241       20.67  2.00    Yes   Sat  Dinner     2
242       15.82  1.75     No   Sat  Dinner     2
243       16.78  3.00     No  Thur  Dinner     2

[244 rows x 6 columns]

重命名列#

In [29]: tips.rename(columns={"total_bill": "total_bill_2"})
Out[29]: 
     total_bill_2   tip     sex smoker   day    time  size
0           14.99  1.01  Female     No   Sun  Dinner     2
1            8.34  1.66    Male     No   Sun  Dinner     3
2           19.01  3.50    Male     No   Sun  Dinner     3
3           21.68  3.31    Male     No   Sun  Dinner     2
4           22.59  3.61  Female     No   Sun  Dinner     4
..            ...   ...     ...    ...   ...     ...   ...
239         27.03  5.92    Male     No   Sat  Dinner     3
240         25.18  2.00  Female    Yes   Sat  Dinner     2
241         20.67  2.00    Male    Yes   Sat  Dinner     2
242         15.82  1.75    Male     No   Sat  Dinner     2
243         16.78  3.00  Female     No  Thur  Dinner     2

[244 rows x 7 columns]

按值排序#

Stata 通过 sort 命令进行排序。

sort sex total_bill

pandas 有一个 DataFrame.sort_values() 方法,它接受一个要排序的列列表。

In [30]: tips = tips.sort_values(["sex", "total_bill"])

In [31]: tips
Out[31]: 
     total_bill    tip     sex smoker   day    time  size
67         1.07   1.00  Female    Yes   Sat  Dinner     1
92         3.75   1.00  Female    Yes   Fri  Dinner     2
111        5.25   1.00  Female     No   Sat  Dinner     1
145        6.35   1.50  Female     No  Thur   Lunch     2
135        6.51   1.25  Female     No  Thur   Lunch     2
..          ...    ...     ...    ...   ...     ...   ...
182       43.35   3.50    Male    Yes   Sun  Dinner     3
156       46.17   5.00    Male     No   Sun  Dinner     6
59        46.27   6.73    Male     No   Sat  Dinner     4
212       46.33   9.00    Male     No   Sat  Dinner     4
170       48.81  10.00    Male    Yes   Sat  Dinner     3

[244 rows x 7 columns]

字符串处理#

查找字符串长度#

Stata 使用 strlen()ustrlen() 函数分别确定 ASCII 和 Unicode 字符串的长度。

generate strlen_time = strlen(time)
generate ustrlen_time = ustrlen(time)

您可以使用 Series.str.len() 查找字符字符串的长度。在 Python 3 中,所有字符串都是 Unicode 字符串。 len 包括尾随空格。使用 lenrstrip 排除尾随空格。

In [32]: tips["time"].str.len()
Out[32]: 
67     6
92     6
111    6
145    5
135    5
      ..
182    6
156    6
59     6
212    6
170    6
Name: time, Length: 244, dtype: int64

In [33]: tips["time"].str.rstrip().str.len()
Out[33]: 
67     6
92     6
111    6
145    5
135    5
      ..
182    6
156    6
59     6
212    6
170    6
Name: time, Length: 244, dtype: int64

查找子字符串的位置#

Stata 使用 strpos() 函数确定字符串中字符的位置。它接受第一个参数定义的字符串,并搜索您作为第二个参数提供的子字符串的第一个位置。

generate str_position = strpos(sex, "ale")

您可以使用 Series.str.find() 方法查找字符串列中字符的位置。 find 搜索子字符串的第一个位置。如果找到子字符串,该方法将返回其位置。如果未找到,它将返回 -1。请记住,Python 索引从零开始。

In [34]: tips["sex"].str.find("ale")
Out[34]: 
67     3
92     3
111    3
145    3
135    3
      ..
182    1
156    1
59     1
212    1
170    1
Name: sex, Length: 244, dtype: int64

按位置提取子字符串#

Stata 使用 substr() 函数根据其位置从字符串中提取子字符串。

generate short_sex = substr(sex, 1, 1)

使用 pandas,你可以使用 [] 符号根据位置提取字符串的子字符串。请记住,Python 索引从零开始。

In [35]: tips["sex"].str[0:1]
Out[35]: 
67     F
92     F
111    F
145    F
135    F
      ..
182    M
156    M
59     M
212    M
170    M
Name: sex, Length: 244, dtype: object

提取第 n 个单词#

Stata 的 word() 函数从字符串中返回第 n 个单词。第一个参数是要解析的字符串,第二个参数指定要提取的单词。

clear
input str20 string
"John Smith"
"Jane Cook"
end

generate first_name = word(name, 1)
generate last_name = word(name, -1)

在 pandas 中提取单词最简单的方法是按空格分割字符串,然后通过索引引用单词。请注意,如果你需要更强大的方法,还有其他方法。

In [36]: firstlast = pd.DataFrame({"String": ["John Smith", "Jane Cook"]})

In [37]: firstlast["First_Name"] = firstlast["String"].str.split(" ", expand=True)[0]

In [38]: firstlast["Last_Name"] = firstlast["String"].str.rsplit(" ", expand=True)[1]

In [39]: firstlast
Out[39]: 
       String First_Name Last_Name
0  John Smith       John     Smith
1   Jane Cook       Jane      Cook

更改大小写#

Stata 的 strupper()strlower()strproper()ustrupper()ustrlower()ustrtitle() 函数分别更改 ASCII 和 Unicode 字符串的大小写。

clear
input str20 string
"John Smith"
"Jane Cook"
end

generate upper = strupper(string)
generate lower = strlower(string)
generate title = strproper(string)
list

等效的 pandas 方法是 Series.str.upper()Series.str.lower()Series.str.title().

In [40]: firstlast = pd.DataFrame({"string": ["John Smith", "Jane Cook"]})

In [41]: firstlast["upper"] = firstlast["string"].str.upper()

In [42]: firstlast["lower"] = firstlast["string"].str.lower()

In [43]: firstlast["title"] = firstlast["string"].str.title()

In [44]: firstlast
Out[44]: 
       string       upper       lower       title
0  John Smith  JOHN SMITH  john smith  John Smith
1   Jane Cook   JANE COOK   jane cook   Jane Cook

合并#

以下表格将在合并示例中使用

In [45]: df1 = pd.DataFrame({"key": ["A", "B", "C", "D"], "value": np.random.randn(4)})

In [46]: df1
Out[46]: 
  key     value
0   A  0.469112
1   B -0.282863
2   C -1.509059
3   D -1.135632

In [47]: df2 = pd.DataFrame({"key": ["B", "D", "D", "E"], "value": np.random.randn(4)})

In [48]: df2
Out[48]: 
  key     value
0   B  1.212112
1   D -0.173215
2   D  0.119209
3   E -1.044236

在 Stata 中,要执行合并,一个数据集必须在内存中,另一个数据集必须作为磁盘上的文件名引用。相反,Python 必须同时拥有两个 DataFrames 在内存中。

默认情况下,Stata 执行外部联接,其中两个数据集的所有观测值在合并后都保留在内存中。可以使用 _merge 变量中创建的值,仅保留初始数据集、合并数据集或两个数据集交集的观测值。

* First create df2 and save to disk
clear
input str1 key
B
D
D
E
end
generate value = rnormal()
save df2.dta

* Now create df1 in memory
clear
input str1 key
A
B
C
D
end
generate value = rnormal()

preserve

* Left join
merge 1:n key using df2.dta
keep if _merge == 1

* Right join
restore, preserve
merge 1:n key using df2.dta
keep if _merge == 2

* Inner join
restore, preserve
merge 1:n key using df2.dta
keep if _merge == 3

* Outer join
restore
merge 1:n key using df2.dta

pandas DataFrame 具有 merge() 方法,提供类似的功能。数据不需要预先排序,不同的联接类型可以通过 how 关键字实现。

In [49]: inner_join = df1.merge(df2, on=["key"], how="inner")

In [50]: inner_join
Out[50]: 
  key   value_x   value_y
0   B -0.282863  1.212112
1   D -1.135632 -0.173215
2   D -1.135632  0.119209

In [51]: left_join = df1.merge(df2, on=["key"], how="left")

In [52]: left_join
Out[52]: 
  key   value_x   value_y
0   A  0.469112       NaN
1   B -0.282863  1.212112
2   C -1.509059       NaN
3   D -1.135632 -0.173215
4   D -1.135632  0.119209

In [53]: right_join = df1.merge(df2, on=["key"], how="right")

In [54]: right_join
Out[54]: 
  key   value_x   value_y
0   B -0.282863  1.212112
1   D -1.135632 -0.173215
2   D -1.135632  0.119209
3   E       NaN -1.044236

In [55]: outer_join = df1.merge(df2, on=["key"], how="outer")

In [56]: outer_join
Out[56]: 
  key   value_x   value_y
0   A  0.469112       NaN
1   B -0.282863  1.212112
2   C -1.509059       NaN
3   D -1.135632 -0.173215
4   D -1.135632  0.119209
5   E       NaN -1.044236

缺失数据#

pandas 和 Stata 都具有表示缺失数据的机制。

pandas 使用特殊浮点值 NaN(非数字)来表示缺失数据。许多语义是相同的;例如,缺失数据会通过数值运算传播,并且默认情况下会被聚合忽略。

In [57]: outer_join
Out[57]: 
  key   value_x   value_y
0   A  0.469112       NaN
1   B -0.282863  1.212112
2   C -1.509059       NaN
3   D -1.135632 -0.173215
4   D -1.135632  0.119209
5   E       NaN -1.044236

In [58]: outer_join["value_x"] + outer_join["value_y"]
Out[58]: 
0         NaN
1    0.929249
2         NaN
3   -1.308847
4   -1.016424
5         NaN
dtype: float64

In [59]: outer_join["value_x"].sum()
Out[59]: -3.5940742896293765

一个区别是,缺失数据不能与其哨兵值进行比较。例如,在 Stata 中,您可以执行以下操作来过滤缺失值。

* Keep missing values
list if value_x == .
* Keep non-missing values
list if value_x != .

在 pandas 中,可以使用 Series.isna()Series.notna() 来过滤行。

In [60]: outer_join[outer_join["value_x"].isna()]
Out[60]: 
  key  value_x   value_y
5   E      NaN -1.044236

In [61]: outer_join[outer_join["value_x"].notna()]
Out[61]: 
  key   value_x   value_y
0   A  0.469112       NaN
1   B -0.282863  1.212112
2   C -1.509059       NaN
3   D -1.135632 -0.173215
4   D -1.135632  0.119209

pandas 提供了 处理缺失数据的多种方法。以下是一些示例

删除包含缺失值的行#

In [62]: outer_join.dropna()
Out[62]: 
  key   value_x   value_y
1   B -0.282863  1.212112
3   D -1.135632 -0.173215
4   D -1.135632  0.119209

从前一行向前填充#

In [63]: outer_join.ffill()
Out[63]: 
  key   value_x   value_y
0   A  0.469112       NaN
1   B -0.282863  1.212112
2   C -1.509059  1.212112
3   D -1.135632 -0.173215
4   D -1.135632  0.119209
5   E -1.135632 -1.044236

用指定的值替换缺失值#

使用平均值

In [64]: outer_join["value_x"].fillna(outer_join["value_x"].mean())
Out[64]: 
0    0.469112
1   -0.282863
2   -1.509059
3   -1.135632
4   -1.135632
5   -0.718815
Name: value_x, dtype: float64

分组#

聚合#

Stata 的 collapse 可用于按一个或多个关键变量进行分组,并对数值列进行聚合计算。

collapse (sum) total_bill tip, by(sex smoker)

pandas 提供灵活的 groupby 机制,允许类似的聚合操作。有关更多详细信息和示例,请参见 groupby 文档

In [65]: tips_summed = tips.groupby(["sex", "smoker"])[["total_bill", "tip"]].sum()

In [66]: tips_summed
Out[66]: 
               total_bill     tip
sex    smoker                    
Female No          869.68  149.77
       Yes         527.27   96.74
Male   No         1725.75  302.00
       Yes        1217.07  183.07

转换#

在 Stata 中,如果需要将组聚合与原始数据集一起使用,通常会使用 bysortegen()。例如,要根据吸烟者组为每个观察值减去平均值。

bysort sex smoker: egen group_bill = mean(total_bill)
generate adj_total_bill = total_bill - group_bill

pandas 提供了 转换 机制,允许在一次操作中简洁地表达这些类型的操作。

In [67]: gb = tips.groupby("smoker")["total_bill"]

In [68]: tips["adj_total_bill"] = tips["total_bill"] - gb.transform("mean")

In [69]: tips
Out[69]: 
     total_bill    tip     sex smoker   day    time  size  adj_total_bill
67         1.07   1.00  Female    Yes   Sat  Dinner     1      -17.686344
92         3.75   1.00  Female    Yes   Fri  Dinner     2      -15.006344
111        5.25   1.00  Female     No   Sat  Dinner     1      -11.938278
145        6.35   1.50  Female     No  Thur   Lunch     2      -10.838278
135        6.51   1.25  Female     No  Thur   Lunch     2      -10.678278
..          ...    ...     ...    ...   ...     ...   ...             ...
182       43.35   3.50    Male    Yes   Sun  Dinner     3       24.593656
156       46.17   5.00    Male     No   Sun  Dinner     6       28.981722
59        46.27   6.73    Male     No   Sat  Dinner     4       29.081722
212       46.33   9.00    Male     No   Sat  Dinner     4       29.141722
170       48.81  10.00    Male    Yes   Sat  Dinner     3       30.053656

[244 rows x 8 columns]

按组处理#

除了聚合之外,pandas groupby 可用于复制 Stata 中大多数其他 bysort 处理。例如,以下示例列出了按性别/吸烟者组在当前排序顺序中的第一个观察值。

bysort sex smoker: list if _n == 1

在 pandas 中,这将写成

In [70]: tips.groupby(["sex", "smoker"]).first()
Out[70]: 
               total_bill   tip   day    time  size  adj_total_bill
sex    smoker                                                      
Female No            5.25  1.00   Sat  Dinner     1      -11.938278
       Yes           1.07  1.00   Sat  Dinner     1      -17.686344
Male   No            5.51  2.00  Thur   Lunch     2      -11.678278
       Yes           5.25  5.15   Sun  Dinner     2      -13.506344

其他注意事项#

磁盘与内存#

pandas 和 Stata 都完全在内存中运行。这意味着 pandas 能够加载的数据大小受计算机内存的限制。如果需要核心外处理,一种可能性是 dask.dataframe 库,它为磁盘上的 DataFrame 提供了 pandas 功能的子集。