pandas 文档字符串指南#

关于文档字符串和标准#

Python 文档字符串是用于记录 Python 模块、类、函数或方法的字符串,以便程序员无需阅读实现细节即可理解其功能。

此外,通常的做法是从文档字符串自动生成在线(html)文档。 Sphinx 用于此目的。

下一个示例可以说明文档字符串的外观

def add(num1, num2):
    """
    Add up two integer numbers.

    This function simply wraps the ``+`` operator, and does not
    do anything interesting, except for illustrating what
    the docstring of a very simple function looks like.

    Parameters
    ----------
    num1 : int
        First number to add.
    num2 : int
        Second number to add.

    Returns
    -------
    int
        The sum of ``num1`` and ``num2``.

    See Also
    --------
    subtract : Subtract one integer from another.

    Examples
    --------
    >>> add(2, 2)
    4
    >>> add(25, 0)
    25
    >>> add(10, -10)
    0
    """
    return num1 + num2

存在一些关于文档字符串的标准,这使得它们更易于阅读,并且允许它们轻松导出为其他格式,如 html 或 pdf。

每个 Python 文档字符串都应遵循的第一个约定定义在 PEP-257 中。

由于 PEP-257 相当宽泛,因此还存在其他更具体的标准。对于 pandas,遵循 NumPy 文档字符串约定。这些约定在本文件中进行了说明。

numpydoc 是一个 Sphinx 扩展,用于支持 NumPy 文档字符串约定。

该标准使用 reStructuredText (reST)。reStructuredText 是一种标记语言,允许在纯文本文件中编码样式。有关 reStructuredText 的文档可以在以下位置找到:

pandas 提供了一些帮助程序,用于在相关类之间共享文档字符串,请参阅 共享文档字符串

本文档的其余部分将总结以上所有指南,并提供 pandas 项目特有的其他约定。

编写文档字符串#

一般规则#

文档字符串必须用三个双引号定义。文档字符串之前或之后不应留有空行。文本从引号行之后开始。结束引号应单独占一行(意味着它们不与最后一句在同一行)。

极少数情况下,文档字符串中会使用 reST 样式,如粗体或斜体,但通常会包含行内代码,用反引号括起来。以下内容被视为行内代码:

  • 参数的名称

  • Python 代码、模块、函数、内置函数、类型、字面量……(例如 oslistnumpy.absdatetime.dateTrue

  • pandas 类(形式为 :class:`pandas.Series`

  • pandas 方法(形式为 :meth:`pandas.Series.sum`

  • pandas 函数(形式为 :func:`pandas.to_datetime`

注意

要仅显示链接的类、方法或函数的最后一个组件,请在其前面加上 ~。例如,:class:`~pandas.Series` 将链接到 pandas.Series,但仅显示最后一部分 Series 作为链接文本。有关详细信息,请参阅 Sphinx 交叉引用语法

def add_values(arr):
    """
    Add the values in ``arr``.

    This is equivalent to Python ``sum`` of :meth:`pandas.Series.sum`.

    Some sections are omitted here for simplicity.
    """
    return sum(arr)

def func():

    """Some function.

    With several mistakes in the docstring.

    It has a blank line after the signature ``def func():``.

    The text 'Some function' should go in the line after the
    opening quotes of the docstring, not in the same line.

    There is a blank line between the docstring and the first line
    of code ``foo = 1``.

    The closing quotes should be in the next line, not in this one."""

    foo = 1
    bar = 2
    return foo + bar

第 1 部分:简短摘要#

简短摘要是简洁地描述函数功能的单一句子。

简短摘要必须以大写字母开头,以句号结尾,并占一行。它需要描述对象的用途,而不提供详细信息。对于函数和方法,简短摘要必须以不定式动词开头。

def astype(dtype):
    """
    Cast Series type.

    This section will provide further details.
    """
    pass

def astype(dtype):
    """
    Casts Series type.

    Verb in third-person of the present simple, should be infinitive.
    """
    pass
def astype(dtype):
    """
    Method to cast Series type.

    Does not start with verb.
    """
    pass
def astype(dtype):
    """
    Cast Series type

    Missing dot at the end.
    """
    pass
def astype(dtype):
    """
    Cast Series type from its current type to the new type defined in
    the parameter dtype.

    Summary is too verbose and doesn't fit in a single line.
    """
    pass

第 2 部分:扩展摘要#

扩展摘要提供了函数功能的详细信息。它不应深入讨论参数的细节,或讨论实现说明,这些内容应放在其他部分。

在简短摘要和扩展摘要之间留有一个空行。扩展摘要中的每个段落都以句号结尾。

扩展摘要应提供函数有用性的原因及其用例,如果它们不是过于笼统的话。

def unstack():
    """
    Pivot a row index to columns.

    When using a MultiIndex, a level can be pivoted so each value in
    the index becomes a column. This is especially useful when a subindex
    is repeated for the main index, and data is easier to visualize as a
    pivot table.

    The index level will be automatically removed from the index when added
    as columns.
    """
    pass

第 3 部分:参数#

参数的详细信息将在此部分添加。此部分标题为“Parameters”,后面跟着一个与“Parameters”一词的每个字母对齐的连字符行。在节标题之前留有一个空行,但之后不留,在“Parameters”一词行和连字符行之间也不留。

标题之后,签名中的每个参数都必须进行文档记录,包括 *args**kwargs,但不包括 self

参数通过其名称定义,后跟一个空格、一个冒号、另一个空格和类型(或类型)。请注意,名称和冒号之间的空格很重要。对于 *args**kwargs 没有定义类型,但所有其他参数都必须定义类型。参数定义之后,必须有一行缩进的参数描述,该描述可以有多行。描述必须以大写字母开头,并以句号结尾。

对于带有默认值的关键字参数,默认值将列在类型末尾的逗号之后。在这种情况下,类型的确切形式将是“int, default 0”。在某些情况下,解释默认参数的含义可能很有用,可以在逗号之后添加“int, default -1, meaning all cpus”。

当默认值为 None 时,表示该值不会被使用。而不是 "str, default None",首选写法是 "str, optional"。当 None 是一个被使用的值时,我们将保留“str, default None”的形式。例如,在 df.to_csv(compression=None) 中,None 不是一个被使用的值,而是表示压缩是可选的,如果不提供则不使用压缩。在这种情况下,我们将使用 "str, optional"。只有在 func(value=None)None 被使用的值与 0foo 的使用方式相同的情况下,我们才会指定“str, int or None, default None”。

class Series:
    def plot(self, kind, color='blue', **kwargs):
        """
        Generate a plot.

        Render the data in the Series as a matplotlib plot of the
        specified kind.

        Parameters
        ----------
        kind : str
            Kind of matplotlib plot.
        color : str, default 'blue'
            Color name or rgb code.
        **kwargs
            These parameters will be passed to the matplotlib plotting
            function.
        """
        pass

class Series:
    def plot(self, kind, **kwargs):
        """
        Generate a plot.

        Render the data in the Series as a matplotlib plot of the
        specified kind.

        Note the blank line between the parameters title and the first
        parameter. Also, note that after the name of the parameter ``kind``
        and before the colon, a space is missing.

        Also, note that the parameter descriptions do not start with a
        capital letter, and do not finish with a dot.

        Finally, the ``**kwargs`` parameter is missing.

        Parameters
        ----------

        kind: str
            kind of matplotlib plot
        """
        pass

参数类型#

指定参数类型时,可以直接使用 Python 内置数据类型(优先使用 Python 类型而不是更冗长的字符串、整数、布尔值等)。

  • int

  • float

  • str

  • bool

对于复杂类型,请定义子类型。对于 dicttuple,由于存在多种类型,我们使用括号来方便阅读类型(字典使用花括号,元组使用圆括号)。

  • int 列表

  • str : int 的字典

  • (str, int, int) 的元组

  • (str,) 的元组

  • str 的集合

如果只允许一组值,则将它们放在花括号中并用逗号(后跟空格)分隔。如果这些值是序数且有顺序,请按此顺序排列。否则,先列出默认值(如果存在)。

  • {0, 10, 25}

  • {‘simple’, ‘advanced’}

  • {‘low’, ‘medium’, ‘high’}

  • {‘cat’, ‘dog’, ‘bird’}

如果类型定义在 Python 模块中,则必须指定模块。

  • datetime.date

  • datetime.datetime

  • decimal.Decimal

如果类型在包中,则还必须指定模块。

  • numpy.ndarray

  • scipy.sparse.coo_matrix

如果类型是 pandas 类型,除了 Series 和 DataFrame 外,还需指定 pandas。

  • Series

  • DataFrame

  • pandas.Index

  • pandas.Categorical

  • pandas.arrays.SparseArray

如果精确类型不重要,但必须与 NumPy 数组兼容,则可以指定 array-like。如果接受任何可迭代的类型,则可以使用 iterable。

  • array-like

  • iterable

如果接受多种类型,则用逗号分隔,最后一个类型前需要用“or”分隔。

  • int 或 float

  • float, decimal.Decimal 或 None

  • str 或 str 列表

如果 None 是可接受的值之一,它必须始终放在列表的最后。

对于轴,约定使用类似以下形式:

  • axis : {0 or ‘index’, 1 or ‘columns’, None}, default None

第 4 部分:返回或产生#

如果方法返回一个值,它将在本节中记录。方法产生输出时也同样记录。

本节的标题将以与“Parameters”相同的方式定义。名称为“Returns”或“Yields”,后面跟着一个与前面单词字母数相同的连字符行。

返回值的文档记录方式与参数类似。但在此情况下,除非方法返回或产生多个值(值元组),否则不会提供名称。

“Returns”和“Yields”的类型与“Parameters”的类型相同。此外,描述必须以句号结尾。

例如,对于单个值

def sample():
    """
    Generate and return a random number.

    The value is sampled from a continuous uniform distribution between
    0 and 1.

    Returns
    -------
    float
        Random number generated.
    """
    return np.random.random()

对于多个值

import string

def random_letters():
    """
    Generate and return a sequence of random letters.

    The length of the returned string is also random, and is also
    returned.

    Returns
    -------
    length : int
        Length of the returned string.
    letters : str
        String of random letters.
    """
    length = np.random.randint(1, 10)
    letters = ''.join(np.random.choice(string.ascii_lowercase)
                      for i in range(length))
    return length, letters

如果方法产生其值

def sample_values():
    """
    Generate an infinite sequence of random numbers.

    The values are sampled from a continuous uniform distribution between
    0 and 1.

    Yields
    ------
    float
        Random number generated.
    """
    while True:
        yield np.random.random()

第 5 部分:另请参阅#

本节用于告知用户与正在文档化的功能相关的 pandas 功能。极少数情况下,如果完全找不到相关的方法或函数,可以跳过此节。

一个明显的例子是 head()tail() 方法。因为 tail() 执行的功能与 head() 相同,只是在 SeriesDataFrame 的末尾而不是开头,所以最好让用户知道它。

为了直观地理解什么是相关的,这里有一些例子

  • lociloc,因为它们执行相同的功能,但在一个情况下提供索引,另一个情况下提供位置。

  • maxmin,因为它们执行相反的操作。

  • iterrowsitertuplesitems,因为用户寻找遍历列的方法时很容易找到遍历行的迭代器,反之亦然。

  • fillnadropna,因为这两种方法都用于处理缺失值。

  • read_csvto_csv,因为它们是互补的。

  • mergejoin,因为一个是一个的泛化。

  • astypepandas.to_datetime,因为用户可能正在阅读 astype 的文档以了解如何转换为日期,而这样做的方式是使用 pandas.to_datetime

  • wherenumpy.where 相关,因为其功能基于后者。

在决定什么相关时,您应该主要运用常识,并考虑对于阅读文档的用户(尤其是经验较少的用户)来说什么是有用的。

当引用其他库(主要是 numpy)时,请先使用模块名称(而不是别名,如 np)。如果函数位于非主模块中,例如 scipy.sparse,请列出完整的模块(例如 scipy.sparse.coo_matrix)。

本节有一个标题“See Also”(注意 S 和 A 大写),后面跟着连字符行,前面有一个空行。

标题之后,我们将为每个相关的方法或函数添加一行,后跟一个空格、一个冒号、另一个空格,以及一个简短的描述,说明该方法或函数的作用、为何在此上下文中相关,以及被文档化的函数与被引用的函数之间的主要区别。描述也必须以句号结尾。

请注意,“Returns”和“Yields”中的描述位于类型后面的行上。而在此节中,描述位于同一行,中间用冒号分隔。如果描述无法在一行内显示,可以继续到下一行,该行必须进一步缩进。

例如:

class Series:
    def head(self):
        """
        Return the first 5 elements of the Series.

        This function is mainly useful to preview the values of the
        Series without displaying the whole of it.

        Returns
        -------
        Series
            Subset of the original series with the 5 first values.

        See Also
        --------
        Series.tail : Return the last 5 elements of the Series.
        Series.iloc : Return a slice of the elements in the Series,
            which can also be used to return the first or last n.
        """
        return self.iloc[:5]

第 6 部分:说明#

这是一个可选部分,用于说明算法实现方面的注意事项,或记录函数行为的技术方面。

您可以选择跳过此部分,除非您熟悉算法的实现,或者在为函数编写示例时发现了某些违反直觉的行为。

此部分遵循与扩展摘要部分相同的格式。

第 7 部分:示例#

这是文档字符串中最重要的部分之一,尽管它放在最后,因为人们通常通过示例比通过准确的解释更能理解概念。

文档字符串中的示例除了说明函数或方法的用法外,还必须是有效的 Python 代码,能够以确定的方式返回给定输出,并且用户可以复制并运行。

示例以 Python 终端会话的形式呈现。>>> 用于表示代码。... 用于表示上一行的代码延续。Sphinx 会在生成输出的代码行之后立即显示输出(之间没有空行)。描述示例的注释可以添加在它们之前和之后,并用空行分隔。

示例如下所示:

  1. 导入所需的库(除了 numpypandas

  2. 创建示例所需的数据

  3. 展示一个非常基本的示例,该示例可以说明最常见的用例

  4. 添加带有解释的示例,说明如何使用参数来实现扩展功能

一个简单的例子可以是

class Series:

    def head(self, n=5):
        """
        Return the first elements of the Series.

        This function is mainly useful to preview the values of the
        Series without displaying all of it.

        Parameters
        ----------
        n : int
            Number of values to return.

        Return
        ------
        pandas.Series
            Subset of the original series with the n first values.

        See Also
        --------
        tail : Return the last n elements of the Series.

        Examples
        --------
        >>> ser = pd.Series(['Ant', 'Bear', 'Cow', 'Dog', 'Falcon',
        ...                'Lion', 'Monkey', 'Rabbit', 'Zebra'])
        >>> ser.head()
        0   Ant
        1   Bear
        2   Cow
        3   Dog
        4   Falcon
        dtype: object

        With the ``n`` parameter, we can change the number of returned rows:

        >>> ser.head(n=3)
        0   Ant
        1   Bear
        2   Cow
        dtype: object
        """
        return self.iloc[:n]

示例应尽可能简洁。如果函数的复杂性需要较长的示例,建议使用带有粗体标题的块。使用双星号 ** 将文本设为粗体,例如 **this example**

示例约定#

示例中的代码假定始终以这两行开头,这两行不显示

import numpy as np
import pandas as pd

示例中使用的任何其他模块都必须明确导入,每行一个(如 PEP 8#imports 所推荐),并避免使用别名。避免过多的导入,但如果需要,标准库的导入应放在前面,然后是第三方库(如 matplotlib)。

当用单个 Series 说明示例时,使用名称 ser,当用单个 DataFrame 说明示例时,使用名称 df。对于索引,idx 是首选名称。如果使用一组同类的 SeriesDataFrame,则将它们命名为 ser1ser2ser3… 或 df1df2df3…。如果数据不同类,并且需要多个结构,则将它们命名为有意义的名称,例如 df_maindf_to_join

示例中使用的数据应尽可能紧凑。建议行数为 4 行左右,但应使用对特定示例有意义的数量。例如,在 head 方法中,需要大于 5 行才能显示带有默认值的示例。如果计算 mean,我们可以使用类似 [1, 2, 3] 的值,这样很容易看到返回的值是平均值。

对于更复杂的示例(例如分组),避免使用无解释的数据,如列为 A、B、C、D… 的随机数矩阵。而是使用有意义的示例,这使得概念更容易理解。除非示例需要,否则使用动物名称,以保持示例的一致性。以及它们的数值属性。

调用方法时,首选关键字参数 head(n=3) 而非位置参数 head(3)

class Series:

    def mean(self):
        """
        Compute the mean of the input.

        Examples
        --------
        >>> ser = pd.Series([1, 2, 3])
        >>> ser.mean()
        2
        """
        pass


    def fillna(self, value):
        """
        Replace missing values by ``value``.

        Examples
        --------
        >>> ser = pd.Series([1, np.nan, 3])
        >>> ser.fillna(0)
        [1, 0, 3]
        """
        pass

    def groupby_mean(self):
        """
        Group by index and return mean.

        Examples
        --------
        >>> ser = pd.Series([380., 370., 24., 26],
        ...               name='max_speed',
        ...               index=['falcon', 'falcon', 'parrot', 'parrot'])
        >>> ser.groupby_mean()
        index
        falcon    375.0
        parrot     25.0
        Name: max_speed, dtype: float64
        """
        pass

    def contains(self, pattern, case_sensitive=True, na=numpy.nan):
        """
        Return whether each value contains ``pattern``.

        In this case, we are illustrating how to use sections, even
        if the example is simple enough and does not require them.

        Examples
        --------
        >>> ser = pd.Series('Antelope', 'Lion', 'Zebra', np.nan)
        >>> ser.contains(pattern='a')
        0    False
        1    False
        2     True
        3      NaN
        dtype: bool

        **Case sensitivity**

        With ``case_sensitive`` set to ``False`` we can match ``a`` with both
        ``a`` and ``A``:

        >>> s.contains(pattern='a', case_sensitive=False)
        0     True
        1    False
        2     True
        3      NaN
        dtype: bool

        **Missing values**

        We can fill missing values in the output using the ``na`` parameter:

        >>> ser.contains(pattern='a', na=False)
        0    False
        1    False
        2     True
        3    False
        dtype: bool
        """
        pass

def method(foo=None, bar=None):
    """
    A sample DataFrame method.

    Do not import NumPy and pandas.

    Try to use meaningful data, when it makes the example easier
    to understand.

    Try to avoid positional arguments like in ``df.method(1)``. They
    can be all right if previously defined with a meaningful name,
    like in ``present_value(interest_rate)``, but avoid them otherwise.

    When presenting the behavior with different parameters, do not place
    all the calls one next to the other. Instead, add a short sentence
    explaining what the example shows.

    Examples
    --------
    >>> import numpy as np
    >>> import pandas as pd
    >>> df = pd.DataFrame(np.random.randn(3, 3),
    ...                   columns=('a', 'b', 'c'))
    >>> df.method(1)
    21
    >>> df.method(bar=14)
    123
    """
    pass

让示例通过 doctests 的技巧#

让示例通过验证脚本中的 doctests 有时会很棘手。以下是一些注意事项:

  • 导入所有必需的库(除了 pandas 和 NumPy,它们已作为 import pandas as pdimport numpy as np 导入),并定义示例中使用的所有变量。

  • 尽量避免使用随机数据。然而,在某些情况下,随机数据可能是可以接受的,例如,如果您正在文档化的函数处理概率分布,或者使函数结果有意义所需的数据量过大,以至于手动创建非常麻烦。在这些情况下,请始终使用固定的随机种子,以使生成的示例可预测。示例:

    >>> np.random.seed(42)
    >>> df = pd.DataFrame({'normal': np.random.normal(100, 5, 20)})
    
  • 如果您有一个包装了多行的代码片段,您需要在继续的行上使用“…”

    >>> df = pd.DataFrame([[1, 2, 3], [4, 5, 6]], index=['a', 'b', 'c'],
    ...                   columns=['A', 'B'])
    
  • 如果要显示引发异常的情况,可以这样做:

    >>> pd.to_datetime(["712-01-01"])
    Traceback (most recent call last):
    OutOfBoundsDatetime: Out of bounds nanosecond timestamp: 712-01-01 00:00:00
    

    包含“Traceback (most recent call last):”是必不可少的,但对于实际的错误,只需要错误名称就足够了。

  • 如果结果中有很少一部分可能变化(例如,对象表示中的哈希),您可以使用 ... 来表示这部分。

    如果您想显示 s.plot() 返回一个 matplotlib AxesSubplot 对象,这将导致 doctest 失败。

    >>> s.plot()
    <matplotlib.axes._subplots.AxesSubplot at 0x7efd0c0b0690>
    

    但是,您可以这样做(请注意需要添加的注释):

    >>> s.plot()
    <matplotlib.axes._subplots.AxesSubplot at ...>
    

示例中的绘图#

pandas 中有一些方法会返回绘图。为了在文档中渲染示例生成的绘图,存在 .. plot:: 指令。

要使用它,请在“Examples”标题之后放置以下代码,如下所示。在构建文档时,绘图将自动生成。

class Series:
    def plot(self):
        """
        Generate a plot with the ``Series`` data.

        Examples
        --------

        .. plot::
            :context: close-figs

            >>> ser = pd.Series([1, 2, 3])
            >>> ser.plot()
        """
        pass

共享文档字符串#

pandas 有一个系统,可以在类之间共享文档字符串(带有细微变化)。这有助于我们保持文档字符串的一致性,同时保持阅读者的清晰度。这会带来一些编写上的复杂性。

每个共享的文档字符串都有一个带有变量的基模板,例如 {klass}。这些变量稍后使用 doc 装饰器填充。最后,还可以使用 doc 装饰器附加文档字符串。

在此示例中,我们将像通常一样创建一个父文档字符串(这类似于 pandas.core.generic.NDFrame)。然后我们将有两个子类(类似于 pandas.Seriespandas.DataFrame)。我们将用类名替换此文档字符串中的变量。

class Parent:
    @doc(klass="Parent")
    def my_function(self):
        """Apply my function to {klass}."""
        ...


class ChildA(Parent):
    @doc(Parent.my_function, klass="ChildA")
    def my_function(self):
        ...


class ChildB(Parent):
    @doc(Parent.my_function, klass="ChildB")
    def my_function(self):
        ...

生成的文档字符串是

>>> print(Parent.my_function.__doc__)
Apply my function to Parent.
>>> print(ChildA.my_function.__doc__)
Apply my function to ChildA.
>>> print(ChildB.my_function.__doc__)
Apply my function to ChildB.

注意

  1. 我们“附加”了父文档字符串到子文档字符串,子文档字符串最初是空的。

我们的文件通常会包含一个模块级别的 _shared_doc_kwargs,其中包含一些常见的替换值(例如 klassaxes 等)。

您可以使用类似以下方式一次性替换和附加:

@doc(template, **_shared_doc_kwargs)
def my_function(self):
    ...

其中 template 可能来自模块级别的 _shared_docs 字典,该字典将函数名映射到文档字符串。 wherever possible, we prefer using doc, since the docstring-writing processes is slightly closer to normal.

请参阅 pandas.core.generic.NDFrame.fillna 作为模板示例,并参阅 pandas.Series.fillnapandas.core.generic.frame.fillna 作为填充后的版本。